29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0323 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  764    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  40 
 
 
367 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  35.77 
 
 
368 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  31.55 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  36.4 
 
 
449 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1753  hypothetical protein  31.51 
 
 
340 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  30.45 
 
 
349 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  33.16 
 
 
305 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  43.09 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  31.55 
 
 
357 aa  77  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  32.65 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  30.83 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  30.61 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  32.2 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  31.76 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  40.57 
 
 
486 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  29.71 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  24.38 
 
 
521 aa  60.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  36.73 
 
 
369 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  30.21 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  44.44 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4478  hypothetical protein  33.67 
 
 
355 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  40 
 
 
549 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3827  hypothetical protein  29.7 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.344263  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  30.21 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4851  hypothetical protein  25.74 
 
 
580 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  27.27 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03695  hypothetical protein  29.11 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1451  hypothetical protein  31.43 
 
 
372 aa  43.5  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>