76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8008 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8008  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 		 303 aa  587  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5524  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  75.17 
 
 		 328 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2452  late competence protein ComER  24.23 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00347201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0740  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.73 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3054  late competence protein ComER  20.65 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4225  late competence protein ComER  19.77 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.755037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4350  late competence protein ComER  19.77 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4409  late competence protein ComER  20.15 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4461  late competence protein ComER  19.77 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000265732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.81 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4179  late competence protein ComER  19.77 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4448  late competence protein ComER  19.77 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0500501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0789  late competence protein ComER  19.77 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0125118  hitchhiker  0.000000168646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0999  late competence protein ComER  25 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1294  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.1 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0466034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.19 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.88 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.99 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  18.52 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.56 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4073  late competence protein ComER  18.5 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.29 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4063  late competence protein ComER  18.5 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00294057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4554  late competence protein ComER  18.5 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00155928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  18.52 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  17.28 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.73 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  18.52 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  17.7 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  17.7 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  17.7 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  18.7 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  17.7 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2120  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.36 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.71 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  26.8 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.51 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.95 
 
 		 272 aa  49.3  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.95 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  16.46 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.22 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.3 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0198  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.92 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0185  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.92 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3513  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.13 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.4 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0240  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.92 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5103  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.92 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.47 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  16.46 
 
 		 272 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0217  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.92 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0188  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.92 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  23.14 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.73 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.98 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.24 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  17.99 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  16.8 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  21.7 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  16.8 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.4 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.47 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.02 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0223  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.42 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.1 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2117  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25 
 
 		 247 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.6 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.85 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0408643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.66 
 
 		 266 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.59 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.1 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0217  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.42 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1003  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.85 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.17 
 
 		 272 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>