20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5633 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5633  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  737    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0014  hypothetical protein  59.64 
 
 
367 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869851  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1881  hypothetical protein  41.3 
 
 
364 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  24.17 
 
 
324 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0335  hypothetical protein  23.19 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0122365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  24.57 
 
 
322 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0250  hypothetical protein  23.48 
 
 
339 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1606  hypothetical protein  25.63 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  35.64 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  26.16 
 
 
398 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1448  hypothetical protein  54.05 
 
 
372 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0697  hypothetical protein  19.75 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0716574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  51.35 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  26.32 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  50 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  27.66 
 
 
350 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  25.35 
 
 
333 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  41.67 
 
 
364 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1237  hypothetical protein  23.76 
 
 
298 aa  42.7  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>