49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5388 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5388  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 389 aa  776    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5587  monooxygenase FAD-binding  41.71 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0585344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5077  hypothetical protein  42.3 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192036  normal  0.166404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1535  monooxygenase, FAD-binding  39.19 
 
 		 398 aa  259  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6617  monooxygenase FAD-binding  36.08 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0142  hypothetical protein  32.5 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1352  hypothetical protein  43.87 
 
 		 157 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1353  hypothetical protein  38.27 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.506771  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0322  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.51 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.657239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3004  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.51 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000162425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1828  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.51 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2914  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.51 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000488899  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  30.77 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5222  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.19 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1405  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.85 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431587  normal  0.559254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2670  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  32.06 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0062  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  30.48 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.441254  hitchhiker  0.00000948983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1221  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.2 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000618146  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4587  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  28.9 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3133  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  31.82 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.113474  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0681  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.86 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0215428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0425  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0485  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.22 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000031061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0997  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  21.07 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0593  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.87 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2332  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.69 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1198  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  31.28 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0862  hypothetical protein  24.81 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.108949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01232  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.03 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02229  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.53 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0629  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.42 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1640  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.13 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571236  normal  0.32038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  25 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0865  hypothetical protein  24.44 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3829  hypothetical protein  24.44 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0254394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3426  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.81 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3327  hypothetical protein  26.55 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3622  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25.3 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2163  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0817  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  26.52 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0219172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02701  hypothetical protein  26.55 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000736715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.02 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02738  hypothetical protein  26.55 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000569805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  25.08 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3234  hypothetical protein  26.55 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3065  hypothetical protein  26.55 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.2507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3512  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.47 
 
 		 438 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.418598  normal  0.690858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5197  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.18 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4149  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.62 
 
 		 399 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>