68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5323 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  100 
 
 		 179 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  88.83 
 
 		 179 aa  327  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  76.73 
 
 		 176 aa  245  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  74.21 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  73.58 
 
 		 176 aa  237  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  68.09 
 
 		 187 aa  237  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  66.25 
 
 		 178 aa  220  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  69.68 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  55.76 
 
 		 175 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  54.55 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  53.16 
 
 		 173 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  50 
 
 		 178 aa  154  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  58.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  46.93 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  46.91 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  46.37 
 
 		 177 aa  147  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  45.45 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  45.83 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  48.47 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  46.24 
 
 		 184 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  46.75 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  44.81 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  45.45 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  44.81 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  46.2 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  41.36 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  41.56 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  38.51 
 
 		 167 aa  104  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  41.32 
 
 		 195 aa  97.8  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  31.64 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  32.87 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  37.58 
 
 		 166 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  39.51 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  45.71 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  36.05 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  37.16 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  35.86 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  29.61 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  31.43 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  31.88 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  31.43 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  31.65 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  31.88 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  31.88 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  29.93 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  30 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  26.35 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  23.23 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  29.87 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  27.46 
 
 		 138 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  26.76 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  26.76 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  23.65 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  26 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  31.53 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  27.83 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  25.47 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  24.32 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>