15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4356 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4588  hypothetical protein  57.65 
 
 		 692 aa  695    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5049  hypothetical protein  58.74 
 
 		 679 aa  710    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326897  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4356  hypothetical protein  100 
 
 		 688 aa  1356    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  32.72 
 
 		 752 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4108  Parallel beta-helix repeat protein  24.87 
 
 		 721 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  29.53 
 
 		 689 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  23.6 
 
 		 838 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  21.85 
 
 		 677 aa  57.4  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  20.82 
 
 		 1302 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  20.66 
 
 		 898 aa  52  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.46 
 
 		 644 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.81 
 
 		 789 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  36.54 
 
 		 627 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1121 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  19.53 
 
 		 965 aa  44.3  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>