15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2796 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2796  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  269  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260349  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  46.96 
 
 		 568 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  39.32 
 
 		 562 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  37.66 
 
 		 419 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3756  hypothetical protein  44.83 
 
 		 437 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  40 
 
 		 500 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  40 
 
 		 582 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  40 
 
 		 520 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  40.91 
 
 		 631 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  31.37 
 
 		 436 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  31.82 
 
 		 612 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  37.33 
 
 		 411 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  33.78 
 
 		 553 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  27.91 
 
 		 602 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  25.93 
 
 		 568 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>