121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1292 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  83 
 
 
337 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  58.36 
 
 
342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  58.07 
 
 
342 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  58.36 
 
 
342 aa  352  8e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  55.24 
 
 
337 aa  328  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  53.02 
 
 
326 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  53 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  49.83 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  53 
 
 
404 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  53 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  53 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  52.63 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  52.51 
 
 
339 aa  259  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  55.25 
 
 
314 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1921  hypothetical protein  49.02 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  43.31 
 
 
318 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  46.83 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  46.12 
 
 
329 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  47.77 
 
 
308 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  45.45 
 
 
323 aa  232  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  44.37 
 
 
314 aa  232  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  42.76 
 
 
308 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  44.22 
 
 
333 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  42.91 
 
 
324 aa  209  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  38.05 
 
 
309 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  36.46 
 
 
310 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  39.1 
 
 
303 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000919  endo-1,4-beta-xylanase  40.32 
 
 
303 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  40.62 
 
 
305 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  37.89 
 
 
286 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0342677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  34.84 
 
 
301 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  36.97 
 
 
281 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2001  xylanase  36.82 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  39.09 
 
 
319 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  38.78 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  37.61 
 
 
319 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  33.56 
 
 
333 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  34.38 
 
 
306 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  36.96 
 
 
289 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  35.55 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  37.02 
 
 
267 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  34.3 
 
 
299 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  38.56 
 
 
346 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  37.85 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  32.87 
 
 
293 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  38.55 
 
 
258 aa  126  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01948  xylanase  35.51 
 
 
249 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2345  hypothetical protein  29.64 
 
 
274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  37.5 
 
 
270 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  31.95 
 
 
334 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1475  esterase/lipase  33.75 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  35.09 
 
 
280 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0112  esterase/lipase  31.12 
 
 
272 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.81923e-16 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3014  acetyl esterase  34.43 
 
 
277 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0258039  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0788  esterase/lipase-like  31.29 
 
 
305 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  29.49 
 
 
303 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  29.25 
 
 
287 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22340  esterase/lipase  31.73 
 
 
261 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308782  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  27.37 
 
 
291 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01320  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 
255 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000546639  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  29.37 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  31.68 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  28.03 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  29.36 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1725  hypothetical protein  28.12 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0809  xylanase  34.6 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  28.1 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0810  hypothetical protein  28.62 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2516  Esterase/lipase-like protein  35.05 
 
 
329 aa  67  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228669  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4378  Esterase/lipase-like protein  22.31 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1549  esterase/lipase-like protein  28.57 
 
 
238 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1562  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.81 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3240  hypothetical protein  26.99 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  39.77 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.04 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  31.31 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  30.13 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  38.26 
 
 
593 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  29.67 
 
 
408 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  36.36 
 
 
644 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.55 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  24.2 
 
 
300 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  32 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.66 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3898  hypothetical protein  28.31 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  25.4 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.52 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  27.49 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  28.79 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  29.01 
 
 
322 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  28.79 
 
 
334 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.06 
 
 
420 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  28.57 
 
 
340 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  26.22 
 
 
306 aa  46.2  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  26.8 
 
 
391 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.52 
 
 
288 aa  46.2  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>