More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1276 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 207 aa  400  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  87.68 
 
 		 204 aa  317  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  70 
 
 		 217 aa  254  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  67 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  78.07 
 
 		 212 aa  246  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  69.31 
 
 		 206 aa  234  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  65.8 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  56.12 
 
 		 194 aa  213  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  58.46 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  56.25 
 
 		 199 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  54.08 
 
 		 194 aa  200  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  55.5 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  56.85 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  55.26 
 
 		 199 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  55.73 
 
 		 195 aa  197  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  55.96 
 
 		 200 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  52.88 
 
 		 199 aa  191  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  53.65 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  54.59 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  58.08 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  53.97 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  51.81 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  51.3 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  56.57 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  50.26 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  56.19 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  51.04 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  56.19 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  56.91 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  52.6 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  51.24 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  55.15 
 
 		 197 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  53.68 
 
 		 197 aa  174  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  56.73 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  50.78 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  61.05 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  54.29 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  53.12 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  51.03 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  51.71 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  44.27 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  54.74 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  45.96 
 
 		 211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  47.16 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  44.72 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  44.22 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  46.82 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  36.08 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  36.08 
 
 		 200 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  36.08 
 
 		 200 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  36.08 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  38.66 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  36.08 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  39.15 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  29.38 
 
 		 297 aa  112  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  42.27 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  35.57 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  43.18 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  35.57 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  40.1 
 
 		 541 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  41.92 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  35.9 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  35.64 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  38.42 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0277  dephospho-CoA kinase  32.31 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  42.55 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  35.05 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  38.62 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  35.05 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  38.62 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  38.62 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  43.09 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  38.14 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  42.02 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2316  dephospho-CoA kinase  33.69 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  32.37 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  37.63 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  35.79 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  36.45 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2490  dephospho-CoA kinase  37.22 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0712492 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  30.46 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2821  dephospho-CoA kinase  37.37 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  39.36 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  40.96 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0801  dephospho-CoA kinase  32.2 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.178857  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2167  dephospho-CoA kinase  35.64 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.993238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  43.6 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  42.02 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  42.02 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  42.02 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  44.5 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  43.62 
 
 		 198 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  38.59 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3392  dephospho-CoA kinase  31.89 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1809  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  38.71 
 
 		 404 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000846791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  36.56 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  41.71 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1596  dephospho-CoA kinase  32.62 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.956667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>