22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1177 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1804  cupin 2 domain-containing protein  88.97 
 
 		 148 aa  255  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  79.55 
 
 		 141 aa  203  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  79.1 
 
 		 141 aa  203  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1566  cupin 2 domain-containing protein  70.15 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4362  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.43 
 
 		 153 aa  193  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1874  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.25 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.935294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0577  cupin 2 domain-containing protein  60 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.90971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.81 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2974  cupin 2 domain-containing protein  43.65 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  38.03 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  36 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  43.94 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  41.79 
 
 		 200 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  41.57 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.26 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  39.06 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  33.9 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  34.25 
 
 		 129 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>