210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0140 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  100 
 
 
399 aa  819    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  87.94 
 
 
394 aa  726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  60.93 
 
 
371 aa  471  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  63.26 
 
 
372 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  60.65 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  60.92 
 
 
387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  61.64 
 
 
387 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  55.84 
 
 
363 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  51.47 
 
 
399 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  50.26 
 
 
398 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  50.26 
 
 
398 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  51.61 
 
 
405 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  51.44 
 
 
394 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  51.58 
 
 
394 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  51.44 
 
 
394 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  50 
 
 
396 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  52.11 
 
 
394 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  52.37 
 
 
397 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  51.85 
 
 
398 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  52.63 
 
 
397 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  51.85 
 
 
398 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  51.95 
 
 
402 aa  344  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  37.65 
 
 
349 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  37.65 
 
 
349 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  37.65 
 
 
349 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  37.65 
 
 
349 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  37.65 
 
 
349 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  37.35 
 
 
349 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  37.65 
 
 
349 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  37.35 
 
 
349 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  37.35 
 
 
349 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  37.65 
 
 
349 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  38.01 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  38.01 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  37.39 
 
 
349 aa  237  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  38.29 
 
 
357 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  36.66 
 
 
343 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  34.31 
 
 
345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  35.8 
 
 
340 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  37.5 
 
 
342 aa  220  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  34.99 
 
 
344 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  34.69 
 
 
340 aa  203  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  34.11 
 
 
363 aa  195  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  27.11 
 
 
353 aa  145  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  25.52 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0718  peptidase M42 family protein  25.41 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  26.78 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  29.77 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  25.25 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  32.47 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  26.44 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  25.38 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  26.72 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0999  peptidase M42 family protein  25.93 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  26.78 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4635  peptidase M42 family protein  26.39 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148815  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  24.25 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  28.24 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  26.27 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  26.01 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  22.89 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  26.32 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  28.57 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  27.34 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0546  hypothetical protein  23.23 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  20.96 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  26.15 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  25.34 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0522  hypothetical protein  22.13 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  26.52 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  26.15 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  27.14 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  24.26 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  24.44 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  23.19 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  23.19 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4838  M42 family peptidase  23.5 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  23.19 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  23.19 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  23.19 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  26.17 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4829  peptidase, M42 family  23.5 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0253333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4591  M42 family peptidase  21.5 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4428  M42 family deblocking aminopeptidase  21.5 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4446  M42 family deblocking aminopeptidase  23.04 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0268261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4947  M42 family peptidase  21.5 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  23.19 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4813  peptidase, M42 family  23.04 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  26.92 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0681  Cellulase  23.69 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  25.93 
 
 
358 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  25.88 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  26.92 
 
 
356 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  22.75 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  22.89 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  22.89 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  23.1 
 
 
346 aa  66.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  25.6 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  22.89 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  25.68 
 
 
339 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>