25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1825 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  360  7.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  60.84 
 
 
170 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0745  hypothetical protein  47.16 
 
 
183 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3613  hypothetical protein  43.75 
 
 
173 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3907  hypothetical protein  43.12 
 
 
173 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.801532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5085  hypothetical protein  45.51 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.6936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4186  hypothetical protein  43.87 
 
 
170 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.210187 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3519  hypothetical protein  44.3 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0333839 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0321  hypothetical protein  46.58 
 
 
175 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0426683  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2502  hypothetical protein  42.95 
 
 
173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.88856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2101  hypothetical protein  43.51 
 
 
180 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212882  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5349  hypothetical protein  44.23 
 
 
180 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.570428  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2163  hypothetical protein  41.38 
 
 
171 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3899  hypothetical protein  40.85 
 
 
188 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3810  hypothetical protein  34.88 
 
 
186 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  27.39 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  27.4 
 
 
151 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  28.91 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  30.33 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  26.97 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  23.16 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  26.11 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  28.37 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  27.4 
 
 
161 aa  40.8  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>