More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3751 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3751  chromosome segregation ATPase  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626525  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.19 
 
 
270 aa  258  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  49.01 
 
 
264 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  47.66 
 
 
257 aa  248  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49 
 
 
264 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45 
 
 
257 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  47.66 
 
 
257 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.61 
 
 
264 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.83 
 
 
262 aa  245  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  47.6 
 
 
254 aa  245  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  48.41 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.43 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  46.4 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.92 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.81 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.2 
 
 
257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.84 
 
 
270 aa  242  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  47.01 
 
 
253 aa  241  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  48.59 
 
 
259 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  44.87 
 
 
253 aa  240  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  45.63 
 
 
260 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  48.24 
 
 
265 aa  239  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  48.24 
 
 
265 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.83 
 
 
263 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  45.2 
 
 
294 aa  239  5e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.63 
 
 
257 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  50 
 
 
258 aa  238  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.66 
 
 
284 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  46.18 
 
 
262 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  46.83 
 
 
263 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.83 
 
 
263 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  48.22 
 
 
265 aa  237  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  48.02 
 
 
276 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.84 
 
 
253 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.96 
 
 
263 aa  237  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  45.88 
 
 
261 aa  236  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  45.24 
 
 
266 aa  236  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.22 
 
 
263 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  46.64 
 
 
257 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.53 
 
 
262 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  43.53 
 
 
258 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.8 
 
 
262 aa  236  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  45.63 
 
 
262 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  46.03 
 
 
262 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.43 
 
 
263 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.61 
 
 
256 aa  235  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  47.47 
 
 
283 aa  235  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46 
 
 
253 aa  235  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  46.83 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  46.03 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  46.46 
 
 
275 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.65 
 
 
282 aa  235  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.46 
 
 
259 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.44 
 
 
286 aa  235  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  46.03 
 
 
262 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.46 
 
 
259 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  48 
 
 
259 aa  234  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  48.63 
 
 
285 aa  234  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.24 
 
 
262 aa  234  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.24 
 
 
262 aa  234  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.24 
 
 
262 aa  234  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.24 
 
 
262 aa  234  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.84 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.62 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.46 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  43.55 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.75 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.07 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.86 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.86 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.86 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.45 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.52 
 
 
294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.14 
 
 
253 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  42.06 
 
 
255 aa  233  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 
261 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  43.31 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  44.71 
 
 
259 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.71 
 
 
259 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  44.05 
 
 
273 aa  231  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.43 
 
 
263 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.71 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.71 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  44.84 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.31 
 
 
262 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  46.43 
 
 
263 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.27 
 
 
256 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  45.1 
 
 
259 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  44.8 
 
 
253 aa  231  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  43.92 
 
 
264 aa  231  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.84 
 
 
262 aa  231  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  45.85 
 
 
261 aa  230  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  44.84 
 
 
262 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  45.06 
 
 
268 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.47 
 
 
289 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  45.63 
 
 
265 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  44.84 
 
 
262 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.67 
 
 
314 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 
262 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  40.31 
 
 
262 aa  230  1e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>