46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2957 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 100 aa  210  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  44.32 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  43.75 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  44.83 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  44.83 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  40.43 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  44.32 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.7 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.08 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  36.47 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  41.11 
 
 		 101 aa  72  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  38.89 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.23 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  37.89 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  34.48 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  35.29 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.41 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0411  hypothetical protein  38.54 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.368048  normal  0.907384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2095  SpoIIAA family protein  37.08 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2250  SpoIIAA family protein  37.08 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0929846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2367  SpoIIAA family protein  37.08 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00979283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  36.36 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  31.18 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  25.81 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2188  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0156  putative anti-sigma F factor antagonist  29.21 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  32.26 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0196  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  28.12 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2094  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000638227  normal  0.178484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>