20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2915 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2915  hypothetical protein  100 
 
 		 765 aa  1580    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1346  hypothetical protein  29.23 
 
 		 793 aa  160  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  31.94 
 
 		 841 aa  95.9  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5295  hypothetical protein  31.41 
 
 		 1349 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3311  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1082 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.331245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  36.49 
 
 		 751 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  30.77 
 
 		 955 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  32.53 
 
 		 950 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  32.53 
 
 		 950 aa  52  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  30.77 
 
 		 955 aa  51.6  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  23.44 
 
 		 309 aa  50.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  36.59 
 
 		 736 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  33.85 
 
 		 953 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  33.85 
 
 		 953 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  33.85 
 
 		 958 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  33.85 
 
 		 958 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  35.71 
 
 		 695 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  34.18 
 
 		 741 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  26.81 
 
 		 305 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  29.37 
 
 		 734 aa  44.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>