50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1274 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1274  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
212 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0644  aspartate/glutamate/uridylate kinase  94.34 
 
 
212 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0413219  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0179  aspartate/glutamate/uridylate kinase  92.45 
 
 
212 aa  390  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000583538  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0710  aspartate/glutamate/uridylate kinase  77.03 
 
 
209 aa  325  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.155359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1384  aspartate/glutamate/uridylate kinase  61.65 
 
 
220 aa  250  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1317  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.86 
 
 
210 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0494  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.52 
 
 
208 aa  105  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104151  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3438  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  32.73 
 
 
221 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0400881 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0839  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.14 
 
 
206 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2447  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.26 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0254  amino acid kinase family protein  27.83 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1647  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.21 
 
 
209 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000510531  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.41 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2346  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  28.78 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0628  hypothetical protein  29.85 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2457  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  29.58 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330903  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5938  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  28.24 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.0234178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2619  uncharacterized kinase  28.57 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0138067  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2724  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.33 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6500  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.78 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0428834 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2871  amino acid kinase family protein  24.29 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4102  amino acid kinase family protein  29.17 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.94 
 
 
213 aa  62.4  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1843  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.02 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1794  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.99 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2178  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.06 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3140  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.46 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5016  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.12 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.761647  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5320  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.39 
 
 
204 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2332  Uncharacterized aspartokinase uridylate kinase-like protein  21.94 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  23.98 
 
 
247 aa  48.5  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0456  glutamate 5-kinase  25.52 
 
 
381 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0927059  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  25.32 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3071  aspartokinase uridylate kinase-like putative kinase  35.94 
 
 
139 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2877  gamma-glutamyl kinase  27.27 
 
 
272 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.518001  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  25.37 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  26.73 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.18 
 
 
244 aa  45.4  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  20.91 
 
 
234 aa  45.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  42.86 
 
 
296 aa  45.1  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  26.73 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate phosphatase  31.11 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6117  phosphatase KdsC  34.18 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  25.81 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  34.57 
 
 
294 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  24.64 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0947  glutamate 5-kinase  30.69 
 
 
268 aa  41.6  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0230243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  25.22 
 
 
233 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0528  3-deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate phosphatase  31.65 
 
 
178 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1267  glutamate 5-kinase  26.76 
 
 
258 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>