23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1374 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1374  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0651  hypothetical protein  98.04 
 
 
167 aa  298  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.284614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1302  hypothetical protein  97.39 
 
 
153 aa  298  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1311  hypothetical protein  76.47 
 
 
167 aa  241  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138336  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1280  hypothetical protein  55.1 
 
 
161 aa  167  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2500  hypothetical protein  36.05 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0500809  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1852  hypothetical protein  33.59 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0389  hypothetical protein  34.38 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1368  hypothetical protein  29.08 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0947  hypothetical protein  32.88 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1934  Protein of unknown function DUF54  31.13 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0193  hypothetical protein  32.59 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0279066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1798  Protein of unknown function DUF54  29.25 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.354083  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0587  Protein of unknown function DUF54  30.52 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0071  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000262103  hitchhiker  0.00974404 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1534  Protein of unknown function DUF54  33.87 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2396  Protein of unknown function DUF54  28.45 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.719157 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1513  hypothetical protein  29.69 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0938  hypothetical protein  31.54 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0842  hypothetical protein  30.58 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.532651  normal  0.113262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1931  hypothetical protein  29.75 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1387  hypothetical protein  29.31 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0525  hypothetical protein  23.81 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.678708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>