30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1110 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  75 
 
 
452 aa  676    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  74.17 
 
 
453 aa  686    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  894    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  57.93 
 
 
390 aa  369  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  57.52 
 
 
369 aa  348  8e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  38.03 
 
 
456 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  36.98 
 
 
363 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  36.67 
 
 
486 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  46.15 
 
 
450 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  32.66 
 
 
319 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  38.37 
 
 
352 aa  97.1  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  30 
 
 
421 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  36.96 
 
 
414 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  26.58 
 
 
549 aa  83.2  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  39.67 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  38.27 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1536  hypothetical protein  30.5 
 
 
578 aa  69.3  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0469049  hitchhiker  0.00325028 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  31.61 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  26.14 
 
 
349 aa  63.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  29.38 
 
 
449 aa  60.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4851  hypothetical protein  31.53 
 
 
580 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  31.25 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01835  hypothetical protein  30.95 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0670958  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1753  hypothetical protein  38.1 
 
 
340 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  34.17 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  33.05 
 
 
521 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  31.76 
 
 
371 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  29.73 
 
 
341 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4478  hypothetical protein  35 
 
 
355 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1451  hypothetical protein  29 
 
 
372 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>