27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2583 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2583  CcdB-like toxin protein  100 
 
 
102 aa  200  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3183  putative CcdB-like protein  48.04 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1251  hypothetical protein  39.62 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4518  CcdB protein  38.24 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0969396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2488  hypothetical protein  35.85 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1730  hypothetical protein  36.79 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1255  CcdB-like toxin protein  33.33 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.17313  normal  0.206879 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4230  hypothetical protein  38.83 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4745  cytotoxic protein CcdB  31.37 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276116  normal  0.0346458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4794  cytotoxic protein CcdB  31.37 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.824423  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4876  cytotoxic protein CcdB  31.37 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2663  putative CcdB-like protein  32.35 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2987  CcdB-like toxin protein  40.57 
 
 
104 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4253  hypothetical protein  31.37 
 
 
99 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0216  hypothetical protein  32.93 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1475  CcdB protein  33.33 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3417  plasmid maintenance protein CcdB  29.89 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.415149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3989  CcdB-like toxin protein  24.76 
 
 
105 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.409509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0055  CcdB protein  36.67 
 
 
104 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619921  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3105  plasmid maintenance protein CcdB  29.89 
 
 
101 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7279  CcdB-like toxin protein  33.02 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.66787  normal  0.0280543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1555  CcdB protein  30.48 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0853  plasmid maintenance protein CcdB  27.59 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0495  plasmid maintenance protein CcdB  28.74 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4237  hypothetical protein  34.65 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.205088  normal  0.553422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3040  plasmid maintenance protein CcdB  27.59 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3544  plasmid maintenance protein CcdB  27.59 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.125456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>