84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2228 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2228  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  241  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519289  normal  0.0128796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0609  protein of unknown function DUF983  47.37 
 
 
126 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1249  protein of unknown function DUF983  47.83 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4642  hypothetical protein  48.7 
 
 
128 aa  116  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242788  normal  0.0997926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0649  protein of unknown function DUF983  46.49 
 
 
126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.643544  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0724  hypothetical protein  44.35 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  42.98 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0587  hypothetical protein  42.98 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.017099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0525  hypothetical protein  45.13 
 
 
127 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150088  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0473  hypothetical protein  42.11 
 
 
127 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0266  protein of unknown function DUF983  45.13 
 
 
122 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2343  hypothetical protein  44.25 
 
 
122 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.76851  normal  0.642219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0415  hypothetical protein  43.75 
 
 
162 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363772  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1611  hypothetical protein  44.25 
 
 
137 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991152  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3291  hypothetical protein  41.82 
 
 
135 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0674  hypothetical protein  41.74 
 
 
128 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.722288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0563  hypothetical protein  42.73 
 
 
147 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3453  protein of unknown function DUF983  42.98 
 
 
124 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.412881  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3581  protein of unknown function DUF983  42.11 
 
 
124 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3257  hypothetical protein  42.11 
 
 
124 aa  103  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0865368 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4734  protein of unknown function DUF983  41.88 
 
 
128 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6977  protein of unknown function DUF983  44.25 
 
 
128 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.906063  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4793  hypothetical protein  42.73 
 
 
133 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1973  hypothetical protein  43.36 
 
 
139 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0027  hypothetical protein  41.74 
 
 
124 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431177  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4739  protein of unknown function DUF983  43.36 
 
 
143 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0123069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4222  hypothetical protein  44.25 
 
 
168 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.867791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1055  protein of unknown function DUF983  43.75 
 
 
122 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0431012  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0905  protein of unknown function DUF983  46.15 
 
 
131 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4582  hypothetical protein  41.13 
 
 
132 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2074  hypothetical protein  44.25 
 
 
141 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4592  protein of unknown function DUF983  44.25 
 
 
147 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0893278 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0908  protein of unknown function DUF983  42.86 
 
 
122 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0820  hypothetical protein  42.2 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1046  hypothetical protein  41.59 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4500  hypothetical protein  42.37 
 
 
125 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2484  hypothetical protein  42.34 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159149  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3457  hypothetical protein  38.32 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.85085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0261  hypothetical protein  38.32 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1558  protein of unknown function DUF983  37.72 
 
 
130 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.602074  normal  0.0157873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0767  hypothetical protein  39.25 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12977  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6945  protein of unknown function DUF983  38.05 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1400  hypothetical protein  38.32 
 
 
131 aa  84.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0834  hypothetical protein  37.27 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3863  hypothetical protein  38.1 
 
 
181 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2765  hypothetical protein  36.21 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.934534  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3881  hypothetical protein  43.81 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868081  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3573  hypothetical protein  36.27 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.717578 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3673  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4735  hypothetical protein  38.24 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2417  hypothetical protein  39.39 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.000693417  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2237  hypothetical protein  34.31 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.483595  normal  0.0351044 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0571  hypothetical protein  31.31 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0606  hypothetical protein  31.31 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3035  hypothetical protein  38.38 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0408489  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1385  hypothetical protein  30.3 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497809  normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2381  hypothetical protein  32.35 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2338  protein of unknown function DUF983  33.01 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2658  protein of unknown function DUF983  32.35 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3537  hypothetical protein  38.38 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3136  hypothetical protein  31.31 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932871  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2439  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0760053  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2179  hypothetical protein  31.31 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0449499  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1293  hypothetical protein  28.28 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0930  hypothetical protein  29.17 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.849799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1352  hypothetical protein  35.35 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1714  hypothetical protein  35.79 
 
 
146 aa  57.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671018  normal  0.409198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2829  hypothetical protein  35.14 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1754  hypothetical protein  29.79 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6673  hypothetical protein  32.38 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975454  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0544  hypothetical protein  24.79 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3844  protein of unknown function DUF983  34 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0754377 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3981  hypothetical protein  34.33 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881431  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7412  protein of unknown function DUF983  32.08 
 
 
171 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1169  hypothetical protein  37.1 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446143  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0390  hypothetical protein  28 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3024  hypothetical protein  28.16 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2821  hypothetical protein  34.25 
 
 
132 aa  47.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641842  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0159  hypothetical protein  23.36 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0418  hypothetical protein  34.43 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2074  hypothetical protein  34.43 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0271122  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2342  hypothetical protein  34.43 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000430301  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5357  hypothetical protein  27.27 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.831164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0919  hypothetical protein  29 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>