46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0836 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  33.03 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  30.95 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  31.36 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  33.66 
 
 
115 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  31.67 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  27.61 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  33.64 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2121  hypothetical protein  32.76 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  33.64 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  33.66 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  30.08 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  26.09 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  31.78 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  29.41 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0827  hypothetical protein  37.78 
 
 
137 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  32.61 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  35 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  31.15 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  30.09 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  30.09 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  30.09 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  30.09 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  30.09 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  30.09 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  30.09 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  31.82 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  32.95 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  25.87 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  30.09 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  34.88 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  34.88 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  36.78 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0644826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  32.53 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  29.13 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  29.31 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  30.21 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  28.35 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  30.21 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  29.41 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  28.57 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  30.12 
 
 
130 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  30.12 
 
 
130 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  30.12 
 
 
130 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  28.1 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>