49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0010 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0010  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.41127  normal  0.578821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  100 
 
 		 1668 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.972856  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0030  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546773  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0034  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0009  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0054  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0035  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0045  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000307248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_265  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0057  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0063  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0032  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000105255  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11600  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.589046 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0581  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.162856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.884899  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03370  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0046  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.31806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0007  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0061  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-3  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0030  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000541175  normal  0.0247209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0057  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0007  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.110552  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0056  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0114  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00529639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0115  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000730422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0116  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000643012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0054  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0007  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0055  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0005  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0009  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177438  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>