28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2458 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  100 
 
 
69 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0576  transcription factor CBF/NF-Y histone  73.91 
 
 
69 aa  100  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0168926  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0165  transcription factor CBF/NF-Y histone  73.91 
 
 
69 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  70.15 
 
 
68 aa  98.2  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1071  transcription factor CBF/NF-Y histone  66.67 
 
 
68 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0834  transcription factor CBF/NF-Y histone  68.75 
 
 
68 aa  92  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.687128  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  65.15 
 
 
68 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0919  transcription factor CBF/NF-Y histone  68.18 
 
 
68 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766751  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.55 
 
 
69 aa  74.7  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0494  histone  60.94 
 
 
67 aa  73.6  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.957808  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  54.69 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.69 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  54.69 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.69 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  51.56 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  48.44 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1584  histone  47.62 
 
 
69 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  50 
 
 
73 aa  57  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  48.44 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  48.44 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  48.44 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  48.44 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  47.06 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  41.18 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1432  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  40 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0348  transcription factor CBF/NF-Y histone  34.85 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00540  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.288962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0110  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  40.98 
 
 
143 aa  42.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.835787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>