26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5413 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  34.57 
 
 
849 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  34.57 
 
 
849 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0498  hypothetical protein  37.18 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167993  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  31.48 
 
 
568 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  27.37 
 
 
397 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4715  hypothetical protein  29.14 
 
 
176 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3573  hypothetical protein  30.83 
 
 
664 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0309383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  39.34 
 
 
438 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  31.25 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  27.65 
 
 
344 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  31.06 
 
 
357 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1705  hypothetical protein  38.98 
 
 
193 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0018  hypothetical protein  30 
 
 
567 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0884  hypothetical protein  23.88 
 
 
556 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  43.75 
 
 
342 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  43.75 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4974  transposon related protein TniQ (Tn6048)  28.31 
 
 
405 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39202  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  22.15 
 
 
378 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  22.15 
 
 
378 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3008  hypothetical protein  28.31 
 
 
405 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754024 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4043  transposon related protein TniQ (Tn6048)  28.31 
 
 
405 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705627  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  28.9 
 
 
356 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  28.29 
 
 
306 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  37.5 
 
 
366 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>