More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflt04 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mflt04  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000481114  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0701  tRNA-Val  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06828  tRNA-Val  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 155 bp  79.8  0.00000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna025  tRNA-Val  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0656621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00469  tRNA-Val  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00375  tRNA-Val  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna012  tRNA-Val  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000043327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna058  tRNA-Val  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.007323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna033  tRNA-Val  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00250  tRNA-Val  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0005  tRNA-Val  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0001  tRNA-Val  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0080  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000518886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0294  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000261183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4578  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.0827232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5650  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000315313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5666  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000870426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5659  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000220141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5674  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000774972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5687  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000478099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0853  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000111044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5732  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412764  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0055  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0045  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4774  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000014475  hitchhiker  6.83474e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0212  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000868799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5034  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000220203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0272  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0170  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0237549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5725  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0139  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-2  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-3  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-4  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000645962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-5  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000098013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-6  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000153225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0093  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000186576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0036  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0018  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.010388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5709  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000949158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-1  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0417532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-3  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000052933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-4  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00757095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-5  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-6  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000716932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-7  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000452768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0603  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000989267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5819  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000675228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0191  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000034986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5145  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000184879  normal  0.692523 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0778  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34684e-29 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-1  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000230232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-2  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-3  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000779763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-5  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000106447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-6  tRNA-Val  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5003  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0527  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3227999999999999e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5050  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000188833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5653  tRNA-Val  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000741856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0018  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0022012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-1  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-2  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000053562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-3  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-4  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-6  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0045  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0143  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000199332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0097  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0095  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0036  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5633  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0008  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000809396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0072  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000540506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0016  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0063  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.808449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0003  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0031  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044944  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0014  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0020  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0009  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292395  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0080  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0040  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000841644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0027  tRNA-Val  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0074  tRNA-Val  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0054  tRNA-Val  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682201  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0087  tRNA-Val  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197296  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0051  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0042  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279186  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0045  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0252567  normal  0.0396614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0044  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266715 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-1  tRNA-Val  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2568  tRNA-Val  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>