More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0701 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0701  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0011  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000197558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0063  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708072  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt04  tRNA-Val  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000481114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0030  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000010319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0035  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000297756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0051  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0024  tRNA-Val  94 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0168  tRNA-Val  94 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1830  tRNA-Val  94 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.367633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0045  tRNA-Val  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0252567  normal  0.0396614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0042  tRNA-Val  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279186  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2440  tRNA-Val  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2943  tRNA-Val  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2946  tRNA-Val  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.411322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2949  tRNA-Val  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2150  tRNA-Val  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2626  tRNA-Val  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.888803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2629  tRNA-Val  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.8453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2632  tRNA-Val  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.602317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0044  tRNA-Val  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0049  tRNA-Val  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000361087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0079  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.262586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0069  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000032502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0071  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0035  tRNA-Val  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0003  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0022  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0054  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0077  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0013  tRNA-Val  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0080  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000518886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4774  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000014475  hitchhiker  6.83474e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0097  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5650  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000315313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5659  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000220141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5674  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000774972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5687  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000478099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5732  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0170  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0237549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0036  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0018  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0022012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0527  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3227999999999999e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5003  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0041  tRNA-Val  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-2  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-4  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000645962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-5  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000098013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000153225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-1  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0417532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000052933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-4  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00757095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-5  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000716932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-7  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000452768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-1  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000230232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-2  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000779763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-5  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000106447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0853  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000111044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0045  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0139  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0093  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000186576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0191  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000034986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0294  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000261183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5034  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000220203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-1  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-2  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000053562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-4  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5145  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000184879  normal  0.692523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5050  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000188833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0272  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0778  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34684e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0603  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000989267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1227  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.411176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0095  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165095  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0455  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1582  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1617  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.623903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0143  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000199332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0036  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0018  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.010388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0006  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0045  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5633  tRNA-Val  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5709  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000949158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5666  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000870426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5653  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000741856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4578  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.0827232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0212  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000868799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5819  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000675228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5725  tRNA-Val  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0046  tRNA-Val  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0011  tRNA-Val  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0072  tRNA-Val  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0089  tRNA-Val  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000177778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>