268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4067 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4548  hypothetical protein  93.54 
 
 
387 aa  721    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4434  hypothetical protein  99.48 
 
 
387 aa  783    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4067  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  788    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4720  hypothetical protein  53.78 
 
 
366 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2278  hypothetical protein  46.87 
 
 
355 aa  329  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5780  hypothetical protein  49.12 
 
 
361 aa  328  9e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4182  hypothetical protein  46.08 
 
 
358 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221061  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6236  hypothetical protein  44.85 
 
 
363 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2638  hypothetical protein  46.18 
 
 
356 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12684  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3724  hypothetical protein  43.93 
 
 
355 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.994214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0379  hypothetical protein  40.9 
 
 
359 aa  292  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3561  hypothetical protein  41.1 
 
 
388 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0430  hypothetical protein  43.64 
 
 
359 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4711  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
338 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1300  hypothetical protein  31.4 
 
 
348 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
831 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3918  homoserine O-acetyltransferase  33.7 
 
 
345 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  0.0489209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4498  homoserine O-acetyltransferase  26.84 
 
 
379 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202595  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0050  alpha/beta hydrolase fold  27.25 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3584  homoserine O-acetyltransferase  29.16 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382876  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2096  homoserine O-acetyltransferase  26.32 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2859  homoserine O-acetyltransferase  37.76 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3432  hypothetical protein  28.98 
 
 
340 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14330  homoserine O-acetyltransferase  28.45 
 
 
405 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0752  homoserine O-acetyltransferase  28.1 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00772131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0051  homoserine O-acetyltransferase  31.67 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0393  homoserine O-acetyltransferase  24.32 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244956  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7515  hypothetical protein  31.02 
 
 
341 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4562  homoserine O-acetyltransferase  26.78 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  26.67 
 
 
496 aa  87  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4873  homoserine O-acetyltransferase  24.04 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2462  homoserine O-acetyltransferase  27.12 
 
 
368 aa  86.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0385  homoserine O-acetyltransferase  30.23 
 
 
383 aa  86.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.859111  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3190  homoserine O-acetyltransferase  26.87 
 
 
394 aa  86.3  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2886  homoserine O-acetyltransferase  27.96 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4867  homoserine O-acetyltransferase  24.1 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0611  hypothetical protein  27.84 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0231125 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0437  homoserine O-acetyltransferase  27.33 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  25.16 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1125  homoserine O-acetyltransferase  23.55 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000197892  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3002  homoserine O-acetyltransferase  27.86 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.92469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4843  homoserine O-acetyltransferase  24.05 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00942637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0338  homoserine O-acetyltransferase  26.32 
 
 
384 aa  84  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3500  homoserine O-acetyltransferase  25.5 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000120242  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  26.11 
 
 
487 aa  84  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2478  hypothetical protein  31.94 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0540594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4332  homoserine O-acetyltransferase  25.66 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4076  homoserine O-acetyltransferase  33.65 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.66182  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4849  homoserine O-acetyltransferase  23.18 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2822  homoserine O-acetyltransferase  32.55 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4254  homoserine O-acetyltransferase  28.57 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.218969  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  27.3 
 
 
382 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1308  homoserine O-acetyltransferase  32.21 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00994406  normal  0.346812 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3644  homoserine O-acetyltransferase  23.77 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3407  homoserine O-acetyltransferase  24.6 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4482  homoserine O-acetyltransferase  23.27 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1589  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.643722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2563  homoserine O-acetyltransferase  30.39 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0730  homoserine O-acetyltransferase  33.67 
 
 
357 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1766  homoserine O-acetyltransferase  31.77 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0329  homoserine O-acetyltransferase  26.45 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115964 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4629  homoserine O-acetyltransferase  22.95 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.533677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4983  homoserine O-acetyltransferase  22.95 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  27.36 
 
 
492 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3134  homoserine O-acetyltransferase  26.49 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289102  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13740  homoserine O-acetyltransferase  27.78 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.316838  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4432  homoserine O-acetyltransferase  32.81 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.29031  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1581  homoserine O-acetyltransferase  25.75 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.319374 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4463  homoserine O-acetyltransferase  23.27 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  27.3 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0896  hypothetical protein  26.13 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.039913  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0061  homoserine O-acetyltransferase  31.03 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1097  homoserine O-acetyltransferase  27.74 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.076735  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3478  homoserine O-acetyltransferase  26.82 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0188606  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00875  homoserine acetyltransferase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15350)  28.32 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.611267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0373  hypothetical protein  25.55 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0609  homoserine O-acetyltransferase  26.09 
 
 
436 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.110749 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0593  homoserine O-acetyltransferase  30.59 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0321  homoserine O-acetyltransferase  25.75 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1824  homoserine O-acetyltransferase  31.44 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3266  homoserine O-acetyltransferase  26.18 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0598  hypothetical protein  32.98 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.693744  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0842  homoserine O-acetyltransferase  28.21 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  25.73 
 
 
491 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4778  homoserine O-acetyltransferase  25.86 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03040  homoserine O-acetyltransferase  26.73 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1186  homoserine O-acetyltransferase  26.2 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4281  homoserine O-acetyltransferase  25.9 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183607  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0349  homoserine O-acetyltransferase  26.9 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0186  homoserine O-acetyltransferase  30.54 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5323  homoserine O-acetyltransferase  30.5 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3057  homoserine O-acetyltransferase  23.37 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.493314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0676  homoserine O-acetyltransferase  25.96 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0820  homoserine O-acetyltransferase  31.44 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.602432  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4102  homoserine O-acetyltransferase  24.53 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0283  hypothetical protein  28.71 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99545  normal  0.0139101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3037  homoserine O-acetyltransferase  30.54 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4066  homoserine O-acetyltransferase  31.44 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.685956  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0143  homoserine O-acetyltransferase  30.54 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3115  homoserine O-acetyltransferase  30.54 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>