174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2855 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2973  glucan biosynthesis protein D  86.56 
 
 		 558 aa  924    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3081  glucan biosynthesis protein G  97.67 
 
 		 558 aa  1066    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2855  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 		 558 aa  1089    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3903  glucan biosynthesis protein D  60.88 
 
 		 504 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  42.51 
 
 		 559 aa  345  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  42.36 
 
 		 530 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  39.85 
 
 		 540 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  42.16 
 
 		 520 aa  336  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  42.03 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  41.27 
 
 		 504 aa  331  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  41.84 
 
 		 495 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  40.95 
 
 		 545 aa  329  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  42.28 
 
 		 529 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  41.78 
 
 		 514 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 		 522 aa  326  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  39.23 
 
 		 542 aa  326  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  39.23 
 
 		 542 aa  326  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  39.23 
 
 		 542 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  39.23 
 
 		 542 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  39.61 
 
 		 498 aa  323  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  41.52 
 
 		 498 aa  323  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  40.08 
 
 		 545 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  40.2 
 
 		 545 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  40.08 
 
 		 545 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  40.57 
 
 		 544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  39.52 
 
 		 588 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  41.97 
 
 		 525 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  39.52 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  41.7 
 
 		 541 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3377  glucan biosynthesis protein G  40.52 
 
 		 527 aa  315  9e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  43.26 
 
 		 542 aa  312  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  38.51 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  38.51 
 
 		 525 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  41.62 
 
 		 517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  40.2 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1794  glucan biosynthesis protein G  42.48 
 
 		 514 aa  307  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.051512  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  40.73 
 
 		 528 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  40.33 
 
 		 533 aa  306  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  36.18 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  36.18 
 
 		 517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  36.18 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  36.18 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  36.18 
 
 		 517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  36.18 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  36.18 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  36.18 
 
 		 517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  36.18 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03975  glucan biosynthesis protein G  35.6 
 
 		 543 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  41.37 
 
 		 532 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  36.55 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  38.06 
 
 		 522 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  38.73 
 
 		 534 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  37.6 
 
 		 546 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  36.97 
 
 		 522 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  36.11 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  36.11 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  36.11 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  36.11 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  36.11 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  35.08 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  35.76 
 
 		 528 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  37.31 
 
 		 534 aa  300  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  37.27 
 
 		 522 aa  299  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  38.83 
 
 		 519 aa  298  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  41.67 
 
 		 545 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  36.82 
 
 		 522 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  36.86 
 
 		 522 aa  296  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  40.4 
 
 		 519 aa  296  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  37.95 
 
 		 503 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  37.02 
 
 		 536 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  34.65 
 
 		 568 aa  293  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  38.54 
 
 		 505 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  37.58 
 
 		 534 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  38.96 
 
 		 587 aa  291  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  38 
 
 		 604 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  40.32 
 
 		 539 aa  290  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  38.18 
 
 		 559 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  40.76 
 
 		 543 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  40.76 
 
 		 539 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  37.61 
 
 		 579 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  37.82 
 
 		 642 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  39.18 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  34.22 
 
 		 594 aa  289  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  35.16 
 
 		 522 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  38 
 
 		 530 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  35.28 
 
 		 597 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1285  glucan biosynthesis protein G  35.66 
 
 		 519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  37.82 
 
 		 641 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  34.7 
 
 		 562 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  34.7 
 
 		 562 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  34.7 
 
 		 608 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  34.7 
 
 		 562 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  36.96 
 
 		 559 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  40.36 
 
 		 545 aa  283  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  38.72 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  40.08 
 
 		 540 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  33.7 
 
 		 604 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  34.72 
 
 		 604 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  35.03 
 
 		 558 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  38.01 
 
 		 540 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>