30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1000 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  959    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  98.98 
 
 		 493 aa  947    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  82.89 
 
 		 493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  56.65 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  55.36 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  54.8 
 
 		 414 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  41.67 
 
 		 553 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  35.96 
 
 		 534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  32.97 
 
 		 634 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  39.23 
 
 		 540 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  37.5 
 
 		 541 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  38.07 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  35.5 
 
 		 766 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  32.92 
 
 		 465 aa  124  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  33.89 
 
 		 715 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  32.92 
 
 		 465 aa  124  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  34.9 
 
 		 544 aa  123  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  33.95 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  33.17 
 
 		 836 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  33.15 
 
 		 841 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  22.54 
 
 		 499 aa  113  9e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  54.55 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1680 aa  90.1  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  54.41 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  54.41 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  53.85 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  36.11 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.56 
 
 		 2449 aa  57  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  27.84 
 
 		 2272 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30.77 
 
 		 2179 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>