125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0618 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  89.15 
 
 		 129 aa  240  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  57.48 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  48 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  48.8 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  47.2 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  49.59 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  47.97 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  45.97 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  45.08 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  43.2 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  48.8 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  43.44 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  41.27 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  41.27 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  40.94 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  33.59 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4524  flagellar basal body rod protein  63.04 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.996777  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  33.86 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  39.64 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  38.94 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  40.91 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  35.65 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  35.65 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  38.14 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  36.17 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.11 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  31.85 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  33.91 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.91 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  30.66 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.78 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  30.71 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.29 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1763  flagellar basal body rod protein FlgB  31 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.37 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1819  flagellar basal body rod protein FlgB  31 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.1 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1356  flagellar basal body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  28.91 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1560  flagellar basal body rod protein FlgB  30.3 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1531  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1520  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1709  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  28.57 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  26.77 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3636  flagellar basal body rod protein FlgB  45.24 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  26.89 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  26.89 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  26.89 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  26.89 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  26.89 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.7 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1741  flagellar basal body rod protein FlgB  30.19 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.15 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1557  flagellar basal body rod protein FlgB  44.68 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.371547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  36.62 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1674  flagellar basal body rod protein FlgB  44.68 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.17 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.17 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  25.16 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.04 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  32.04 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  27.73 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.21 
 
 		 165 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  34.48 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  40.32 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  25.78 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  29.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3954  flagellar basal-body rod protein FlgB  52.94 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  61.76 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.09 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2411  flagellar basal body rod protein FlgB  48.89 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3070  flagellar basal body rod protein FlgB  48.89 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3025  flagellar basal body rod protein FlgB  48.89 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0258442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  25.21 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  61.76 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3044  flagellar basal body rod protein FlgB  48.89 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2935  flagellar basal body rod protein FlgB  48.89 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 136 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.85 
 
 		 150 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  41.82 
 
 		 132 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  40.62 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.62 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.64 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  42.03 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>