15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3020 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1516  hypothetical protein  97.94 
 
 
1236 aa  874    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3020  hypothetical protein  100 
 
 
1482 aa  2944    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3138  parallel beta-helix repeat-containing protein  97.98 
 
 
1469 aa  889    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1517  hypothetical protein  39.97 
 
 
1230 aa  482  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1798  hypothetical protein  42.53 
 
 
1482 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  55.9 
 
 
1441 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5942  conserved repeat domain protein  30.81 
 
 
2412 aa  291  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  43.75 
 
 
1946 aa  192  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0407  hypothetical protein  28.74 
 
 
1285 aa  125  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480631  hitchhiker  0.000026905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  27.47 
 
 
1129 aa  88.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  26.55 
 
 
900 aa  77.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2441  hypothetical protein  24.85 
 
 
643 aa  53.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  25.08 
 
 
1898 aa  50.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  28.78 
 
 
1516 aa  47.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  26.25 
 
 
3602 aa  46.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>