108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0029 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0050  tRNA-Thr  95.65 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0029  tRNA-Thr  95.65 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553385  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0029  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000331146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000312741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000025626  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0011  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0008  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0245883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2437  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2439  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2442  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2941  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.161896  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2147  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2149  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2152  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2624  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0007  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0032  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.386226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0023  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.177577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0069  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000181822  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0009  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000049137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t005  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t080  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t082  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0004  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000250718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0103  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000642659  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0012  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000230734  normal  0.0248915 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0050  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0052  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000085939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0012  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000866174  hitchhiker  0.00954127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0051  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0041266  normal  0.480692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0053  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0009  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0113  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0423055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0012  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013609  normal  0.0833663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0049  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00847785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0051  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00673114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0010  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000391547  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0033  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000977619  normal  0.440974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0092  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000157949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0094  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00138001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0133  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000500666  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0006  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181943  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0024  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0086  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0209186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0088  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0412207  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0127  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000904299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0011  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0101  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000191032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0103  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000466787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4244  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127626  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4289  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.11347e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0029  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132706  normal  0.393089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0031  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000122273  normal  0.278033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0152  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000140276  hitchhiker  0.00000000136531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0013  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0042  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0044  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0046  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0013  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000751402  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0110  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000430973  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0112  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000415626  normal  0.792835 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1446  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00029205  normal  0.742429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2799  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000124978  normal  0.096994 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0005  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000832804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0069  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.489026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0019  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.979216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0022  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00933326  normal  0.943049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0156  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000748575  hitchhiker  0.000108427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0025  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t007  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000938468  normal  0.123199 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t027  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00943249  normal  0.0402241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t029  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00426722  normal  0.039681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0025  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.287713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0032  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0077  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362174  hitchhiker  0.0000000000991776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0007  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0050  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0595881  unclonable  6.505860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0040  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238807  hitchhiker  0.0000185517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>