More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0057 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000331146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  96.23 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0007  tRNA-Thr  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227553  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0011  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000312741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  94.64 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0008  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0245883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0053  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0015  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101097  hitchhiker  0.004712 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0011  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000646692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0436  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818019  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.607965  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03880  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0309562 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1716  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000136572  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1469  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000598832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0009  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60150  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553385  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2437  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2439  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2442  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2941  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.161896  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2147  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2149  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2152  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2624  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0038  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0023  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.234998  normal  0.014223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0029  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.395178  hitchhiker  0.000010783 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0041  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0012  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0025  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000025626  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0013  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07721  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0007  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0032  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.386226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0069  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000181822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0008  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0978186  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0029  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0014  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t26  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0031  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0049  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1295  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0025  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0013  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000652832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0028  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0418849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0049  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0011  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0578  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0017  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0050  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130847  hitchhiker  0.00000000426742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0006  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000177613  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14030  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.36075e-34  hitchhiker  0.0017768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0011  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000345873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0092  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000386697  hitchhiker  0.0000000672962 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0034  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285979  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R8  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023394  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0025  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0090  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.28119  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0038  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0057  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000681091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>