55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0029 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553385  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0050  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0029  tRNA-Thr  95.65 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0011  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0029  tRNA-Thr  87.84 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000331146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000312741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000025626  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0008  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0245883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0007  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0032  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.386226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2624  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2152  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2149  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2147  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2941  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.161896  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2442  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2439  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2437  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0009  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0069  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000181822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0029  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.951156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0032  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0049  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0014  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0030  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0007  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0040  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238807  hitchhiker  0.0000185517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0050  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0595881  unclonable  6.505860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0077  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362174  hitchhiker  0.0000000000991776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0049  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146124  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0090  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.28119  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0041  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.495782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>