20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2389 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 423 aa  823    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  41.92 
 
 		 413 aa  295  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  34.92 
 
 		 441 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  35.26 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  28.61 
 
 		 612 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1060  hypothetical protein  27.38 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.945271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  26.63 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  24.47 
 
 		 1197 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 		 1297 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7658  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  23.51 
 
 		 719 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6732  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_192  polysaccharide biosynthesis protein  43.94 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.880283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3847  hypothetical protein  25.12 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  23.43 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  21.09 
 
 		 451 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6867  polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 439 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 446 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3590  hypothetical protein  28.76 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>