26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2355 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2355  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0178  hypothetical protein  74.87 
 
 
200 aa  289  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0520859  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0023  hypothetical protein  69.23 
 
 
197 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1660  hypothetical protein  58.6 
 
 
201 aa  227  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000145701  hitchhiker  0.0000000000565897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2541  hypothetical protein  52.75 
 
 
191 aa  211  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1361  hypothetical protein  52.72 
 
 
188 aa  195  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0012643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2221  hypothetical protein  55.03 
 
 
208 aa  191  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0458  conserved hypothetical protein-like protein  53.85 
 
 
213 aa  188  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0137  hypothetical protein  52.2 
 
 
228 aa  187  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2027  hypothetical protein  52.17 
 
 
189 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.968984  normal  0.751952 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1028  hypothetical protein  49.46 
 
 
203 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0861228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1630  hypothetical protein  44.21 
 
 
204 aa  169  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.856032  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1444  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  41.38 
 
 
332 aa  166  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0624  hypothetical protein  47.5 
 
 
550 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802185  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3083  hypothetical protein  46.21 
 
 
615 aa  135  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5195  conserved hypothetical protein-like protein  36.1 
 
 
617 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1373  hypothetical protein  36.96 
 
 
287 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2419  hypothetical protein  44.59 
 
 
520 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1432  hypothetical protein  38.38 
 
 
289 aa  128  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0804678 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0545  hypothetical protein  39.33 
 
 
556 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0168127  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1487  hypothetical protein  43.92 
 
 
282 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.204521  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1249  hypothetical protein  39.34 
 
 
252 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1677  hypothetical protein  32.3 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2102  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.76 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0513  hypothetical protein  36.08 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.651674  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0596  hypothetical protein  26.19 
 
 
257 aa  55.1  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0844954  normal  0.105487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>