14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2115 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2115  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  31.08 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1495  DNA polymerase beta domain protein region  34.92 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3611  hypothetical protein  31.61 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.559317  normal  0.0155573 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  27.46 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  25.9 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  28.16 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  26.29 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  23.46 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2688  DNA polymerase beta domain protein region  26.35 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.373799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 121 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  38.14 
 
 		 111 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>