More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1815 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2373  beta-lactamase domain protein  80.54 
 
 
445 aa  760    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151302  normal  0.285639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2210  beta-lactamase domain-containing protein  79.86 
 
 
445 aa  755    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1815  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
445 aa  917    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2887  beta-lactamase-like  68.64 
 
 
445 aa  657    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339587  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0684  hypothetical protein  65.09 
 
 
447 aa  617  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1418  metallo-beta-lactamase  59.91 
 
 
447 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201803  hitchhiker  0.00374551 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2398  beta-lactamase-like protein  58.33 
 
 
447 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000003377  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0473  beta-lactamase domain-containing protein  55.88 
 
 
446 aa  556  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0561925  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2048  beta-lactamase domain protein  57.53 
 
 
447 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000971225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2539  beta-lactamase domain protein  57.66 
 
 
450 aa  535  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1185  beta-lactamase domain-containing protein  55.2 
 
 
448 aa  533  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1041  beta-lactamase domain-containing protein  54.75 
 
 
448 aa  528  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.467823 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0442  beta-lactamase domain protein  56.76 
 
 
450 aa  530  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0970385  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1059  beta-lactamase domain-containing protein  54.98 
 
 
448 aa  526  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1636  beta-lactamase domain-containing protein  54.52 
 
 
448 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2607  beta-lactamase domain protein  56.5 
 
 
448 aa  527  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.458343 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0905  beta-lactamase domain-containing protein  54.52 
 
 
448 aa  527  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2047  beta-lactamase domain protein  55.63 
 
 
450 aa  509  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0634019  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2069  beta-lactamase domain protein  54.46 
 
 
449 aa  500  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 
558 aa  210  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 
555 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 
560 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  33.26 
 
 
553 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
591 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 
548 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 
555 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  31.07 
 
 
555 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
554 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  31.25 
 
 
553 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 
554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  31.29 
 
 
553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
554 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.8 
 
 
557 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  31.17 
 
 
677 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  31.39 
 
 
559 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.58 
 
 
557 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  30.87 
 
 
557 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 
588 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 
588 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00741  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.25 
 
 
667 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  31 
 
 
558 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
561 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  30.88 
 
 
555 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  30.36 
 
 
557 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
561 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 
557 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.36 
 
 
557 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 
618 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  30.36 
 
 
557 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 
561 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21201  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  32.06 
 
 
649 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.13 
 
 
557 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  30.13 
 
 
557 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1250  hypothetical protein  32.06 
 
 
644 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  31.45 
 
 
551 aa  192  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  31.11 
 
 
563 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  30.86 
 
 
547 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  31.45 
 
 
551 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 
551 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
566 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0066  hypothetical protein  30.51 
 
 
690 aa  189  7e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.672737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
558 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
558 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17781  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  29.53 
 
 
662 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.23805  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 
559 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
558 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  29.52 
 
 
555 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 
555 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 
556 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 
569 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  30.11 
 
 
652 aa  187  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 
556 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  30.43 
 
 
556 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 
593 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  29.52 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 
549 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 
554 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2016  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.64 
 
 
578 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0968063  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0069  hypothetical protein  30.13 
 
 
679 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18421  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  28.86 
 
 
661 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  31.49 
 
 
533 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1744  hypothetical protein  28.86 
 
 
660 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 
583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18611  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  28.86 
 
 
662 aa  183  6e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  31.93 
 
 
556 aa  183  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.7 
 
 
717 aa  183  6e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  29.28 
 
 
662 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1846  hypothetical protein  30.91 
 
 
609 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 
556 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  30.56 
 
 
573 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  29.5 
 
 
662 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  28.57 
 
 
560 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4360  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 
583 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263724  normal  0.359525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>