219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2839 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2929  hypothetical protein  89.02 
 
 		 523 aa  961    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1177  putative electron transport protein  67.11 
 
 		 464 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0190009  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2839  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 524 aa  1092    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5818  hypothetical protein  66.96 
 
 		 457 aa  664    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  normal  0.128266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2616  hypothetical protein  99.81 
 
 		 524 aa  1090    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5428  protein of unknown function DUF162  66.96 
 
 		 464 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2646  protein of unknown function DUF162  98.09 
 
 		 524 aa  1078    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1270  protein of unknown function DUF162  64.5 
 
 		 477 aa  635    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0696  protein of unknown function DUF162  53.98 
 
 		 466 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  52.68 
 
 		 459 aa  488  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  51.77 
 
 		 458 aa  488  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  52.24 
 
 		 457 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  53.12 
 
 		 458 aa  482  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.22 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  52.77 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  51.57 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  51.79 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  48.27 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  51.56 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  47.56 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2997  hypothetical protein  47.33 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3005  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.55 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.81 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  50.69 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.73 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  47.81 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  47.58 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  47.81 
 
 		 464 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1172  iron-sulfur cluster binding protein, putative  48.13 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.04 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2907  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.27 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 457 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.04 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1519  iron-sulfur cluster-binding protein  47.11 
 
 		 464 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  43.77 
 
 		 463 aa  337  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  40.73 
 
 		 470 aa  336  7e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  40.73 
 
 		 470 aa  336  7e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  40.5 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  40.5 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  39.41 
 
 		 475 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  41.74 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  40.37 
 
 		 475 aa  322  8e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  40.83 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  39.81 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  39.81 
 
 		 475 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  39.81 
 
 		 475 aa  317  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  39.81 
 
 		 475 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  40.54 
 
 		 479 aa  317  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  41.69 
 
 		 482 aa  317  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  39.55 
 
 		 470 aa  316  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  39.58 
 
 		 475 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  39.73 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  41.46 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  41.46 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  41.46 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  41.46 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  41.46 
 
 		 482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  44.3 
 
 		 476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  39.58 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  39.58 
 
 		 475 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  38.97 
 
 		 475 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  38.75 
 
 		 473 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  39.74 
 
 		 473 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  40.2 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  40.73 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  39.51 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  39.02 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  39.51 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  39.11 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2430  protein of unknown function DUF162  39.41 
 
 		 481 aa  310  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  35.91 
 
 		 501 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 		 473 aa  309  9e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 		 473 aa  309  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 		 473 aa  309  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 		 473 aa  309  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 		 473 aa  309  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 		 473 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  37.67 
 
 		 480 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 		 473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  35.76 
 
 		 494 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  38.84 
 
 		 469 aa  306  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  39.77 
 
 		 478 aa  306  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  39.33 
 
 		 486 aa  306  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 		 482 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  35.7 
 
 		 493 aa  305  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  35.91 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  40.56 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  37.16 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  41.03 
 
 		 475 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  38.55 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  39.19 
 
 		 484 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  37.91 
 
 		 473 aa  303  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  38.77 
 
 		 473 aa  302  9e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  38.43 
 
 		 472 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0559  hypothetical protein  41.61 
 
 		 488 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.907474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 		 490 aa  302  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  37.72 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  41 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  45.32 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>