18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1961 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1961  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1004    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.159443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1971  hypothetical protein  26.33 
 
 		 474 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1967  hypothetical protein  25 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  28.62 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1962  hypothetical protein  30.77 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  34.23 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  27.5 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  24.16 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.91 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.58 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.22 
 
 		 499 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.09 
 
 		 478 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.99 
 
 		 502 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 554 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.6 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 485 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>