78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1419 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1419  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1362  hypothetical protein  60.47 
 
 
86 aa  90.9  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1324  protein of unknown function UPF0044  46.43 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1687  hypothetical protein  42.86 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25086  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1652  hypothetical protein  42.86 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  39.74 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  35.9 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  35.9 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  35.9 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  35.9 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  35.9 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  35.9 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  34.62 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  35.9 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  35.9 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  35.9 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  34.62 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  35.9 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0164  hypothetical protein  38.1 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14090  conserved hypothetical protein TIGR00253  35.71 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000062411  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0795  hypothetical protein  41.77 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260077  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1520  hypothetical protein  38.46 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1155  hypothetical protein  38.46 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2547  hypothetical protein  38.82 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0888013  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0996  hypothetical protein  37.97 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4333  protein of unknown function UPF0044  37.18 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000519396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0930  protein of unknown function UPF0044  34.18 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00534921  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3199  protein of unknown function UPF0044  34.88 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1236  hypothetical protein  32.05 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000939316  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1160  hypothetical protein  32.05 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0090  protein of unknown function UPF0044  43.28 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2315  protein of unknown function UPF0044  33.33 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0534  protein of unknown function UPF0044  35.71 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000506447  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1894  protein of unknown function UPF0044  33.33 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3014  RNA-binding protein  35.71 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0230  RNA-binding protein  33.33 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1188  protein of unknown function UPF0044  37.18 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00596484  hitchhiker  0.000000832175 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2737  hypothetical protein  33.72 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.438343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1764  hypothetical protein  34.62 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000276764  normal  0.0263174 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2358  protein of unknown function UPF0044  33.72 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.496102  hitchhiker  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1974  hypothetical protein  32 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0180  protein of unknown function UPF0044  29.49 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  35.9 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1739  RNA-binding protein  33.73 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3083  hypothetical protein  30.77 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1663  hypothetical protein  32.14 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.593227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  34.62 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2713  hypothetical protein  30.23 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1465  protein of unknown function UPF0044  34.62 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223382  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2844  hypothetical protein  30.23 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2232  protein of unknown function UPF0044  35.9 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000120736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0729  hypothetical protein  28.21 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.951229 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1584  RNA-binding protein  33.33 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00164206  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0700  protein of unknown function UPF0044  38.71 
 
 
112 aa  43.5  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1772  hypothetical protein  30.23 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.590818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0877  hypothetical protein  38.3 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932104  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0701  protein of unknown function UPF0044  31.76 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0143521  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0283  hypothetical protein  31.03 
 
 
168 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102487  normal  0.840027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3454  hypothetical protein  25.58 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0481  hypothetical protein  29.49 
 
 
95 aa  41.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0235201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6001  protein of unknown function UPF0044  26.74 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2093  putative RNA-binding protein  29.07 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.208178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1637  hypothetical protein  29.49 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2381  putative RNA-binding protein  29.07 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0672076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1184  hypothetical protein  38.1 
 
 
175 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0481  hypothetical protein  25.58 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000159675  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1172  hypothetical protein  38.1 
 
 
175 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2864  protein of unknown function UPF0044  40.48 
 
 
175 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0666776  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1266  hypothetical protein  38.1 
 
 
174 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1260  hypothetical protein  40.48 
 
 
175 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0814  hypothetical protein  38.1 
 
 
174 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1295  hypothetical protein  38.1 
 
 
174 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4437  hypothetical protein  38.1 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1999  protein of unknown function UPF0044  35.29 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0289253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3617  hypothetical protein  30.23 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2025  hypothetical protein  38.1 
 
 
176 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0533  hypothetical protein  25.58 
 
 
111 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000155351  unclonable  0.000000000915772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>