45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0800 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0800  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  157  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.173103  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  92.16 
 
 
397 aa  97.4  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  68.75 
 
 
414 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  64.71 
 
 
417 aa  67.4  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  56.82 
 
 
410 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  61.36 
 
 
414 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  61.22 
 
 
422 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  58.33 
 
 
384 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  48.08 
 
 
417 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  56.52 
 
 
436 aa  50.4  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  55.56 
 
 
413 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  55.56 
 
 
413 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  48.89 
 
 
404 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  52.27 
 
 
413 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  45.83 
 
 
424 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  47.83 
 
 
452 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  51.11 
 
 
420 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.355056 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  54.76 
 
 
411 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  51.11 
 
 
421 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  38.1 
 
 
419 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  40.82 
 
 
441 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  41.03 
 
 
441 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  46.15 
 
 
440 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  43.59 
 
 
441 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  43.59 
 
 
441 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  41.03 
 
 
441 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  47.92 
 
 
427 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  51.22 
 
 
405 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  45 
 
 
427 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  45 
 
 
423 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  48.89 
 
 
433 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  43.59 
 
 
396 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  41.03 
 
 
441 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  41.03 
 
 
441 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  41.03 
 
 
441 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  41.03 
 
 
441 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  44.74 
 
 
400 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  41.03 
 
 
441 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  40 
 
 
577 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  28.95 
 
 
440 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  38.46 
 
 
451 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  37.5 
 
 
421 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  30.26 
 
 
426 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  40 
 
 
444 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  40 
 
 
441 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>