171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0187 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4443  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.63 
 
 
815 aa  934    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0187  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  100 
 
 
829 aa  1675    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0443  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.05 
 
 
751 aa  900    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0582059  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1090  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.47 
 
 
808 aa  905    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4307  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.66 
 
 
815 aa  929    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.424586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1918  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.99 
 
 
833 aa  948    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1064  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  83.11 
 
 
820 aa  1362    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1408  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.95 
 
 
806 aa  936    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.119386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1174  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.83 
 
 
806 aa  951    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.471445  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1160  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.04 
 
 
826 aa  919    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.151954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4452  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.66 
 
 
816 aa  902    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106906  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2294  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  75 
 
 
813 aa  1234    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4462  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.8 
 
 
815 aa  933    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1513  Inorganic diphosphatase  57.32 
 
 
907 aa  906    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34422  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1547  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.22 
 
 
810 aa  944    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0604589  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0829  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  31.55 
 
 
782 aa  251  4e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00399457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2182  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.89 
 
 
706 aa  243  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2253  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.1 
 
 
669 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.627571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.04 
 
 
671 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000164217  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1804  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.05 
 
 
706 aa  240  8e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000195761  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1747  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.65 
 
 
706 aa  239  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264772  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0372  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.86 
 
 
792 aa  237  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2772  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.71 
 
 
700 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3559  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.69 
 
 
779 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306706  normal  0.266916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2641  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.33 
 
 
707 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2985  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.61 
 
 
700 aa  234  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000074507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1812  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.07 
 
 
694 aa  234  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2666  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.21 
 
 
707 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.362236  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0308  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.95 
 
 
682 aa  231  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0657  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.03 
 
 
711 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1349  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.69 
 
 
672 aa  227  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.528352  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2481  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.08 
 
 
775 aa  227  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.618403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.75 
 
 
674 aa  227  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0591536  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0486  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.02 
 
 
654 aa  227  7e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000246606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2905  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  28.69 
 
 
690 aa  227  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409534  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2262  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.99 
 
 
779 aa  227  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0181184  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.02 
 
 
712 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543415  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4030  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.31 
 
 
782 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3931  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.35 
 
 
705 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000543237  normal  0.470613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0496  Inorganic diphosphatase  28.03 
 
 
777 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2678  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.46 
 
 
706 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100661  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4304  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.88 
 
 
779 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35830  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  31.56 
 
 
761 aa  223  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345904  normal  0.0763221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2916  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.01 
 
 
704 aa  223  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348085  normal  0.0128697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1192  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.15 
 
 
712 aa  223  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2013  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.47 
 
 
653 aa  223  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446892  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15760  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.9 
 
 
652 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000521315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0499  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  31.13 
 
 
781 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.911328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7542  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.33 
 
 
715 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3012  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.54 
 
 
706 aa  220  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4826  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  31.48 
 
 
825 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0602  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  30.92 
 
 
753 aa  220  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0824  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.53 
 
 
711 aa  220  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.241185  normal  0.154446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0223  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  31.27 
 
 
778 aa  220  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0994  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.29 
 
 
672 aa  219  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0310  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.71 
 
 
786 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588911  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4411  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.39 
 
 
782 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.917351  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2995  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  31.37 
 
 
681 aa  217  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00639559  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  31.37 
 
 
681 aa  217  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000847476  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1724  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.45 
 
 
719 aa  217  9e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1528  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.37 
 
 
697 aa  216  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0306017  normal  0.605169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1141  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.6 
 
 
712 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0284  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.18 
 
 
786 aa  216  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4642  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.59 
 
 
706 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163123  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0736  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.92 
 
 
766 aa  213  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1919  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  28.66 
 
 
693 aa  211  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3203  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.02 
 
 
688 aa  211  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1973  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.41 
 
 
794 aa  210  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.560457  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1622  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.24 
 
 
712 aa  210  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1428  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.92 
 
 
663 aa  210  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0044  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.36 
 
 
674 aa  209  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22640  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.73 
 
 
791 aa  207  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3088  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.45 
 
 
710 aa  207  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3408  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.45 
 
 
710 aa  207  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.45 
 
 
710 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_004310  BR0771  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.71 
 
 
718 aa  206  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0739  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.12 
 
 
677 aa  206  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6803  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.7 
 
 
715 aa  206  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0762  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.42 
 
 
718 aa  205  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2414  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.47 
 
 
672 aa  204  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0764  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.26 
 
 
775 aa  205  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1101  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.1 
 
 
692 aa  204  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.930953  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1173  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.44 
 
 
694 aa  204  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.229725  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1472  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.61 
 
 
689 aa  204  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1225  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  28.07 
 
 
654 aa  204  8e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1378  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.33 
 
 
718 aa  203  9e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2023  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.53 
 
 
704 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0149188  normal  0.0138521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2524  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.1 
 
 
718 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0686  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.86 
 
 
686 aa  201  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.249632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1479  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.59 
 
 
847 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0134  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.72 
 
 
812 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.602726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3003  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.89 
 
 
692 aa  201  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0005  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.7 
 
 
694 aa  201  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0209  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  28.09 
 
 
712 aa  201  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0186  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.23 
 
 
671 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0934  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  27.07 
 
 
687 aa  200  7.999999999999999e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1425  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.32 
 
 
694 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15815  predicted protein  31.46 
 
 
644 aa  199  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0756  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  27.94 
 
 
711 aa  198  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.145691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  29.66 
 
 
842 aa  198  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>