42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0827 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  100 
 
 
157 aa  306  5e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  62.34 
 
 
156 aa  188  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  61.69 
 
 
156 aa  184  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  61.69 
 
 
156 aa  184  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  60 
 
 
159 aa  178  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  35.17 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  33.33 
 
 
353 aa  75.5  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  34.07 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  33.33 
 
 
349 aa  64.7  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  32.12 
 
 
369 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  31.62 
 
 
368 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  30.41 
 
 
337 aa  60.5  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  28.99 
 
 
367 aa  58.9  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  30.34 
 
 
354 aa  57.8  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  29.2 
 
 
361 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  29.71 
 
 
381 aa  56.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  31.25 
 
 
362 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  33.9 
 
 
385 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  30.43 
 
 
364 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  28.37 
 
 
361 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.51 
 
 
330 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  29.09 
 
 
103 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.32 
 
 
332 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  28.81 
 
 
359 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  28.81 
 
 
359 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  28.68 
 
 
371 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  30.33 
 
 
349 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  30.15 
 
 
353 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.46 
 
 
352 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  27.69 
 
 
352 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  27.69 
 
 
352 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  30.97 
 
 
359 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  27.69 
 
 
352 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  27.69 
 
 
352 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  27.69 
 
 
352 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  25.64 
 
 
343 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.03 
 
 
368 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  26.09 
 
 
365 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  27.86 
 
 
363 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  30.43 
 
 
366 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.38 
 
 
402 aa  40.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>