270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA_Mc5SA on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA_Mc5SA  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc5SB  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.729876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0039  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  99.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0008  5S ribosomal RNA  92.65 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.488687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0013  23S ribosomal RNA  92.65 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607574 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0029  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0932548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0007  5S ribosomal RNA  90 
 
 		 117 bp  95.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.156774  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0279  5S ribosomal RNA  88.61 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446741  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1911  5S RNA  88.61 
 
 		 117 bp  85.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00279415  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0011  5S ribosomal RNA  88.31 
 
 		 115 bp  81.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0014  5S ribosomal RNA  92.73 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.873356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0026  5S ribosomal RNA  92.73 
 
 		 115 bp  77.8  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0005  5S ribosomal RNA  92.16 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0036  5S ribosomal RNA  92.16 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0040  5S ribosomal RNA  92.16 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.852672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna48  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0243319  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna55  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0884571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0007  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00219563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0013  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.149045  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0007  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 113 bp  67.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.951123  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0013  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 113 bp  67.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.118637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0081  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0006  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000380355  hitchhiker  0.00390757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0086  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919882  normal  0.263092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0011  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.712208  hitchhiker  0.00122523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0012  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00125226 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0034  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000354404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0041  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0049  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 115 bp  54  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.119375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0005  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0015  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.651632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0059  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0075  5S ribosomal RNA  85.07 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0069  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733499  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0009  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0900632  hitchhiker  0.000000917011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0003  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000245604 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0003  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.685817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0012  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0032  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0127  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0028  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0004  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.13622  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0070  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0115  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0078  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 113 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0594811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0017  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0006  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000035078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0015  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.832778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0147  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0026  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0619749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0035  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0042  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.190599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0030  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472199 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0016  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000743511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0007  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0024  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0012  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34851  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0134  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0134181  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0119  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0152  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R16  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R45  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.161753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R5  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.378855  normal  0.842536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R56  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R6  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.305961  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R77  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R90  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0021  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.973202  normal  0.0141597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0020  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0029  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0019  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0404714  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0014  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0064  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.648247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0140  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.626199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0012  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0078  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0038  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988118  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0090  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0138  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 121 bp  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0006  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0025  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0023  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0010  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0035  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0135  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0127  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0029  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0003  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0003  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0013  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0102843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0138  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 116 bp  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0010  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0020  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0055  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 115 bp  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533028  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  Wp5SC  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 111 bp  50.1  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.709549  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0006  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000211107  hitchhiker  0.000000000129929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>