17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0491 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  785    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2112  hypothetical protein  45.91 
 
 
437 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2005  hypothetical protein  44.67 
 
 
415 aa  333  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87614  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0438  hypothetical protein  44.04 
 
 
442 aa  326  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0439  hypothetical protein  42.19 
 
 
451 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1701  hypothetical protein  41.25 
 
 
396 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0386  protein of unknown function DUF1597  31.13 
 
 
435 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4410  hypothetical protein  30.67 
 
 
427 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1304  hypothetical protein  28.86 
 
 
421 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1432  hypothetical protein  27.42 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1268  hypothetical protein  27.48 
 
 
461 aa  86.3  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0113688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  26.32 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  25.4 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  23.71 
 
 
388 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  26.16 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0540  hypothetical protein  24.08 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  25.22 
 
 
363 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>