More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf019 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
881 aa  647    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
876 aa  671    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
881 aa  647    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
881 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
881 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl355  valyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
873 aa  657    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.473625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
881 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  41 
 
 
876 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf019  fusion of oligopeptide transport protein OppF and Valyl-tRNA synthetase  100 
 
 
1631 aa  3306    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
881 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
881 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0258  valyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
872 aa  639    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
874 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
880 aa  670    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
881 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  41 
 
 
876 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
881 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
902 aa  640    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
879 aa  645    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
894 aa  657    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
883 aa  637    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
884 aa  672    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
880 aa  671    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
881 aa  648    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
883 aa  636  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
881 aa  635  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
880 aa  628  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
879 aa  625  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
885 aa  623  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
883 aa  612  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
881 aa  609  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
882 aa  607  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
879 aa  597  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
881 aa  598  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  37 
 
 
882 aa  599  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
881 aa  594  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
892 aa  587  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  38 
 
 
879 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
865 aa  587  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
880 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
884 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
880 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
865 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
883 aa  583  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0263  valyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
874 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
880 aa  573  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
885 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
881 aa  566  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
884 aa  560  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
880 aa  557  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
880 aa  557  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 
879 aa  558  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  35.3 
 
 
886 aa  559  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
886 aa  558  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
883 aa  553  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
897 aa  554  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0722  valyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 
895 aa  553  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
888 aa  552  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
888 aa  551  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
880 aa  551  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
883 aa  549  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
892 aa  549  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 
884 aa  545  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
904 aa  546  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
867 aa  545  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
897 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
886 aa  539  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
887 aa  539  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
922 aa  540  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12474  valyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
876 aa  540  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
866 aa  537  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2630  valyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
900 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395848  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
909 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 
909 aa  536  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2036  valyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
918 aa  536  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.895366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5994  valyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
874 aa  534  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298309  normal  0.0937262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1477  valyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 
1052 aa  536  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516539  normal  0.491266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
882 aa  535  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 
909 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
887 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
909 aa  531  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 
883 aa  533  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
907 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3563  valyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
883 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0388  valyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
902 aa  532  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.427268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1569  valyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 
1051 aa  533  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
909 aa  531  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3006  valyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 
909 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
883 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
893 aa  533  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
888 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3631  valyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
883 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1468  valyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
893 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2652  valyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
854 aa  528  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.45272 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
901 aa  527  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2765  valyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
883 aa  530  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.700056 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
874 aa  528  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1474  valyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
1051 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333205  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2029  valyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
904 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
891 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>