23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03786 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03786  putative integral membrane protein  100 
 
 		 250 aa  482  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6207  hypothetical protein  32.27 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449503  normal  0.698789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4367  protein of unknown function DUF81  32.41 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.688319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0689  hypothetical protein  31.43 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309902  normal  0.362532 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3771  hypothetical protein  35.34 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0522  hypothetical protein  34.18 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  33.47 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1995  hypothetical protein  29.48 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4518  hypothetical protein  30.24 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.535232 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5696  protein of unknown function DUF81  35.59 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  28.4 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  30.4 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  25.62 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.22 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  27.2 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  26.92 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  27.35 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  26.5 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  26.53 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  26.46 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  28 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  29.38 
 
 		 240 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>