More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02231 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02231  putative ATP-binding protein in pho regulon  100 
 
 
370 aa  754    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2207  PhoH-like protein  81.87 
 
 
345 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.935668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00628  predicted protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  75.37 
 
 
359 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2966  PhoH family protein  75.37 
 
 
359 aa  518  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.069683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0787  PhoH family protein  75.22 
 
 
348 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0823  PhoH family protein  75.22 
 
 
348 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0689  PhoH family protein  75.37 
 
 
346 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0682  PhoH family protein  75.37 
 
 
346 aa  518  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0121436  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00619  hypothetical protein  75.37 
 
 
359 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0707  PhoH family protein  75.37 
 
 
346 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0340161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0775  PhoH family protein  75.22 
 
 
348 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  0.946623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  74.43 
 
 
365 aa  519  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0714  PhoH family protein  75.22 
 
 
348 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0457534  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2985  PhoH family protein  75.37 
 
 
359 aa  518  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189197  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0753  PhoH family protein  75.37 
 
 
346 aa  518  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00493548  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0728  PhoH family protein  75.22 
 
 
348 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004212  phosphate starvation-inducible protein PhoH  71.94 
 
 
365 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00393498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2949  PhoH family protein  75.29 
 
 
350 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1107  PhoH family protein  74.71 
 
 
351 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0587  PhoH family protein  75.07 
 
 
346 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.139571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1218  PhoH family protein  72.49 
 
 
351 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0284374  normal  0.476314 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  76.45 
 
 
367 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  74.28 
 
 
347 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01229  hypothetical protein  72.27 
 
 
365 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1186  PhoH family protein  73.99 
 
 
348 aa  508  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0119675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2924  PhoH family protein  80.19 
 
 
347 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0071554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1196  PhoH family protein  72.11 
 
 
352 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3135  PhoH family protein  72.11 
 
 
352 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2916  PhoH family protein  74.27 
 
 
357 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0010821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1830  hypothetical protein  74.27 
 
 
357 aa  510  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3006  PhoH family protein  74.27 
 
 
357 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2576  PhoH family protein  80.13 
 
 
356 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1180  PhoH family protein  75.21 
 
 
355 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3262  PhoH family protein  76.11 
 
 
341 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2856  PhoH family protein  76.58 
 
 
349 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0995  PhoH-like protein  72.78 
 
 
356 aa  506  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0457768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3697  PhoH family protein  77.04 
 
 
347 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.104563  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1105  PhoH family protein  76.11 
 
 
348 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3304  PhoH family protein  76.11 
 
 
348 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3440  PhoH family protein  76.11 
 
 
341 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1007  PhoH family protein  74.71 
 
 
354 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.109119  normal  0.0769537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1003  PhoH family protein  73.65 
 
 
354 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00802061  normal  0.173492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1068  PhoH family protein  73.65 
 
 
347 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3472  PhoH family protein  75.83 
 
 
347 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.020153  normal  0.0289175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3138  PhoH family protein  76.44 
 
 
346 aa  498  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0534  PhoH family protein  71.34 
 
 
342 aa  487  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  68.55 
 
 
368 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0345  PhoH-like ATP-binding protein  62.22 
 
 
370 aa  435  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  66.56 
 
 
334 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  65.72 
 
 
350 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  64.17 
 
 
340 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  64.17 
 
 
340 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  63.04 
 
 
332 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  63.04 
 
 
332 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  62.73 
 
 
332 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  63.04 
 
 
332 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  62.08 
 
 
341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  64.35 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  64.35 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  62.34 
 
 
330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  62.42 
 
 
336 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3301  lipoate synthase  60.11 
 
 
364 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  61.83 
 
 
328 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  60 
 
 
328 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  58.72 
 
 
348 aa  388  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0395  PhoH family protein  59.19 
 
 
343 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  59.94 
 
 
328 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  59.93 
 
 
337 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1495  PhoH-like protein  57.59 
 
 
323 aa  378  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0682  PhoH family protein  57.59 
 
 
323 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1948  ATP binding protein  54.43 
 
 
327 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.875532  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1883  PhoH family protein  55.05 
 
 
327 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114064  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  55.59 
 
 
359 aa  378  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2291  PhoH family protein  60.82 
 
 
334 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  57.94 
 
 
322 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1970  PhoH family protein  50.53 
 
 
379 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0372063  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2335  PhoH-like protein  62.18 
 
 
364 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  55.66 
 
 
319 aa  362  8e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0627  putative PhoH-like protein, ATPase  51.23 
 
 
361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.121399  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  57.01 
 
 
327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0591  PhoH-like protein  50.96 
 
 
361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  57.01 
 
 
340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  56.11 
 
 
335 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  55.9 
 
 
335 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  56.63 
 
 
316 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2138  PhoH family protein  56.17 
 
 
331 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888079  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  56.62 
 
 
325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  56.96 
 
 
323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  55.99 
 
 
316 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  56.27 
 
 
316 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  55.42 
 
 
330 aa  349  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  56.59 
 
 
338 aa  347  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2696  PhoH-like protein  56.21 
 
 
346 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  52.31 
 
 
357 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  54.82 
 
 
330 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  55.45 
 
 
339 aa  345  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3528  PhoH-like protein  55.59 
 
 
340 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.959961  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  55.91 
 
 
337 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  56.91 
 
 
338 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0629  putative PhoH-family protein  52.59 
 
 
359 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>