42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7035 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010373  M446_7035    100 
 
 
135 bp  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0950215  normal  0.0781378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  94.92 
 
 
741 bp  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  94.83 
 
 
753 bp  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  93.1 
 
 
753 bp  167  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  92.24 
 
 
705 bp  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6408    91.53 
 
 
309 bp  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  91.53 
 
 
753 bp  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    94.23 
 
 
752 bp  151  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    90.68 
 
 
972 bp  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    89.83 
 
 
753 bp  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.93 
 
 
960 bp  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  89.42 
 
 
753 bp  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  87.93 
 
 
753 bp  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    87.29 
 
 
754 bp  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  87.29 
 
 
228 bp  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    87.29 
 
 
752 bp  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  86.44 
 
 
297 bp  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  86.44 
 
 
753 bp  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.44 
 
 
1041 bp  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  85.59 
 
 
753 bp  99.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  85.59 
 
 
684 bp  99.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    86.11 
 
 
754 bp  95.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  90.79 
 
 
228 bp  95.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  84.75 
 
 
201 bp  91.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  84.48 
 
 
753 bp  87.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3350  putative transposase  85.34 
 
 
162 bp  87.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2990    88.61 
 
 
336 bp  85.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    84.75 
 
 
716 bp  83.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    89.19 
 
 
753 bp  83.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    84.62 
 
 
753 bp  81.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8326    83.05 
 
 
219 bp  75.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  83.05 
 
 
753 bp  75.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    93.75 
 
 
699 bp  71.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6479  hypothetical protein  89.06 
 
 
225 bp  71.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  89.66 
 
 
753 bp  67.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  89.66 
 
 
753 bp  67.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  87.27 
 
 
102 bp  54  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3951  hypothetical protein  89.36 
 
 
111 bp  54  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4257  hypothetical protein  81.52 
 
 
207 bp  48.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8020  hypothetical protein  88.64 
 
 
156 bp  48.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256989  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    88.37 
 
 
391 bp  46.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8600  hypothetical protein  85.19 
 
 
120 bp  44.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>